MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cylindrospermum stagnale PCC 7417

Total Repeats: 137676

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019757	TGG	2	6	21	26	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019757	ATG	2	6	30	35	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402185
3	NC_019757	GTCCC	2	10	92	101	0 %	20 %	20 %	60 %	434402185
4	NC_019757	TGA	2	6	284	289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402185
5	NC_019757	AAT	2	6	339	344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434402185
6	NC_019757	GAA	2	6	362	367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434402185
7	NC_019757	GTA	2	6	417	422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402185
8	NC_019757	TAA	2	6	428	433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434402185
9	NC_019757	TGC	2	6	446	451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402185
10	NC_019757	TGG	2	6	506	511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434402185
11	NC_019757	T	6	6	586	591	0 %	100 %	0 %	0 %	434402185
12	NC_019757	GGC	2	6	674	679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434402185
13	NC_019757	GAT	2	6	696	701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402185
14	NC_019757	AAG	2	6	733	738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434402185
15	NC_019757	T	6	6	741	746	0 %	100 %	0 %	0 %	434402185
16	NC_019757	GTT	2	6	783	788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434402185
17	NC_019757	CTC	2	6	805	810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	434402185
18	NC_019757	ACC	2	6	878	883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434402185
19	NC_019757	A	7	7	913	919	100 %	0 %	0 %	0 %	434402185
20	NC_019757	GTCT	2	8	940	947	0 %	50 %	25 %	25 %	434402185
21	NC_019757	AAT	2	6	984	989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434402185
22	NC_019757	CAG	2	6	1111	1116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402185
23	NC_019757	CGG	3	9	1182	1190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434402185
24	NC_019757	TTGAG	2	10	1443	1452	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019757	ATT	2	6	1476	1481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019757	TTAAG	2	10	1513	1522	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019757	ATTA	2	8	1530	1537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_019757	A	6	6	1578	1583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019757	TA	4	8	1740	1747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019757	AT	3	6	1754	1759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019757	GTA	2	6	1765	1770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_019757	TC	3	6	1908	1913	0 %	50 %	0 %	50 %	434402186
33	NC_019757	TGC	3	9	1967	1975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402186
34	NC_019757	TCACCC	2	12	2189	2200	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	434402186
35	NC_019757	AGA	2	6	2238	2243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434402186
36	NC_019757	AAT	2	6	2259	2264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434402186
37	NC_019757	CAC	2	6	2289	2294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434402186
38	NC_019757	GCA	2	6	2296	2301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402186
39	NC_019757	ATT	2	6	2325	2330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434402186
40	NC_019757	CCA	2	6	2333	2338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434402186
41	NC_019757	GTG	2	6	2339	2344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434402186
42	NC_019757	GCC	2	6	2407	2412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434402186
43	NC_019757	ACT	2	6	2443	2448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434402186
44	NC_019757	TGGG	2	8	2462	2469	0 %	25 %	75 %	0 %	434402186
45	NC_019757	AGA	2	6	2547	2552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434402186
46	NC_019757	GCG	2	6	2694	2699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434402186
47	NC_019757	AGC	2	6	2778	2783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402186
48	NC_019757	AG	3	6	2830	2835	50 %	0 %	50 %	0 %	434402186
49	NC_019757	TGGG	2	8	2978	2985	0 %	25 %	75 %	0 %	434402186
50	NC_019757	ACC	2	6	3134	3139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434402187
51	NC_019757	GTG	2	6	3207	3212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434402187
52	NC_019757	TTG	2	6	3230	3235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434402187
53	NC_019757	TGA	2	6	3342	3347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402187
54	NC_019757	CTGGC	2	10	3493	3502	0 %	20 %	40 %	40 %	434402187
55	NC_019757	TGC	2	6	3513	3518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402187
56	NC_019757	TCA	2	6	3576	3581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434402187
57	NC_019757	GA	3	6	3586	3591	50 %	0 %	50 %	0 %	434402187
58	NC_019757	GGA	2	6	3644	3649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434402187
59	NC_019757	TAA	2	6	3673	3678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434402187
60	NC_019757	GCTC	2	8	3699	3706	0 %	25 %	25 %	50 %	434402187
61	NC_019757	TTG	2	6	3731	3736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434402187
62	NC_019757	GTT	2	6	3818	3823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434402187
63	NC_019757	T	6	6	3868	3873	0 %	100 %	0 %	0 %	434402187
64	NC_019757	T	6	6	3942	3947	0 %	100 %	0 %	0 %	434402187
65	NC_019757	GCG	2	6	3993	3998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434402187
66	NC_019757	AAGC	2	8	4064	4071	50 %	0 %	25 %	25 %	434402187
67	NC_019757	TGG	2	6	4210	4215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434402187
68	NC_019757	GCA	2	6	4276	4281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402187
69	NC_019757	TGT	2	6	4452	4457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434402187
70	NC_019757	TTG	2	6	4529	4534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	434402187
71	NC_019757	CACTC	2	10	4606	4615	20 %	20 %	0 %	60 %	434402187
72	NC_019757	GCCCA	2	10	4696	4705	20 %	0 %	20 %	60 %	434402187
73	NC_019757	AAC	2	6	4752	4757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434402187
74	NC_019757	GATA	2	8	4846	4853	50 %	25 %	25 %	0 %	434402187
75	NC_019757	TGAT	2	8	4883	4890	25 %	50 %	25 %	0 %	434402187
76	NC_019757	TA	3	6	4969	4974	50 %	50 %	0 %	0 %	434402187
77	NC_019757	CTG	2	6	5025	5030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402187
78	NC_019757	AAT	2	6	5043	5048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434402187
79	NC_019757	ACC	2	6	5069	5074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434402187
80	NC_019757	GCA	2	6	5088	5093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402187
81	NC_019757	TCT	2	6	5100	5105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	434402187
82	NC_019757	TAA	2	6	5161	5166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434402187
83	NC_019757	TGC	2	6	5187	5192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402187
84	NC_019757	ACC	2	6	5241	5246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	434402187
85	NC_019757	AGC	2	6	5307	5312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402187
86	NC_019757	AGA	2	6	5351	5356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	434402187
87	NC_019757	AT	3	6	5376	5381	50 %	50 %	0 %	0 %	434402187
88	NC_019757	GAT	2	6	5426	5431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402187
89	NC_019757	CGG	2	6	5533	5538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	434402187
90	NC_019757	TCA	2	6	5544	5549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434402187
91	NC_019757	ATC	2	6	5643	5648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434402187
92	NC_019757	TCGG	2	8	5651	5658	0 %	25 %	50 %	25 %	434402187
93	NC_019757	CCG	2	6	5680	5685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	434402187
94	NC_019757	TCA	2	6	5760	5765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434402187
95	NC_019757	AAAT	2	8	5815	5822	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_019757	A	7	7	5855	5861	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_019757	TAATT	2	10	5867	5876	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_019757	TAA	3	9	5911	5919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_019757	AT	7	14	6122	6135	50 %	50 %	0 %	0 %	434402188
100	NC_019757	TAA	2	6	6626	6631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434402189
101	NC_019757	AGAT	2	8	6655	6662	50 %	25 %	25 %	0 %	434402189
102	NC_019757	A	6	6	6668	6673	100 %	0 %	0 %	0 %	434402189
103	NC_019757	A	6	6	6713	6718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_019757	TAA	2	6	6724	6729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_019757	TTC	2	6	6760	6765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_019757	ACCA	2	8	6790	6797	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_019757	TGA	2	6	6866	6871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019757	ACTT	2	8	6954	6961	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_019757	T	6	6	7013	7018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_019757	AT	3	6	7060	7065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019757	AG	3	6	7094	7099	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019757	AATA	2	8	7121	7128	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019757	CA	3	6	7319	7324	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_019757	TC	3	6	7335	7340	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_019757	TAT	2	6	7365	7370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434402190
116	NC_019757	GAC	2	6	7379	7384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402190
117	NC_019757	TTA	2	6	7385	7390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	434402190
118	NC_019757	TGC	2	6	7398	7403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402190
119	NC_019757	TCACT	2	10	7445	7454	20 %	40 %	0 %	40 %	434402190
120	NC_019757	CAA	2	6	7475	7480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434402190
121	NC_019757	TGC	2	6	7497	7502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402190
122	NC_019757	CAA	2	6	7628	7633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	434402190
123	NC_019757	CAG	2	6	7640	7645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402190
124	NC_019757	ATTT	2	8	7659	7666	25 %	75 %	0 %	0 %	434402190
125	NC_019757	CTG	2	6	7667	7672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402190
126	NC_019757	TGC	2	6	7776	7781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	434402190
127	NC_019757	GGA	2	6	7921	7926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	434402190
128	NC_019757	TACAC	2	10	7933	7942	40 %	20 %	0 %	40 %	434402190
129	NC_019757	CAG	2	6	8016	8021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402190
130	NC_019757	CAG	2	6	8142	8147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402190
131	NC_019757	ACT	2	6	8149	8154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	434402190
132	NC_019757	GCA	2	6	8164	8169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	434402190
133	NC_019757	TAA	2	6	8242	8247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434402190
134	NC_019757	TGC	2	6	8265	8270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_019757	T	6	6	8315	8320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019757	A	6	6	8490	8495	100 %	0 %	0 %	0 %	434402191
137	NC_019757	TTTTTG	2	12	8503	8514	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	434402191
138	NC_019757	GTG	2	6	8524	8529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	434402191
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264	NC_019757	TGA	3	9	14580	14588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	434402197
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267	NC_019757	TG	3	6	14748	14753	0 %	50 %	50 %	0 %	434402197
268	NC_019757	AAT	2	6	14775	14780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	434402197
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392	NC_019757	AAT	2	6	21239	21244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
393	NC_019757	TCAA	2	8	21249	21256	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
394	NC_019757	CAC	2	6	21297	21302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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